Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGSM1Q2NKQ1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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