Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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