Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms