Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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