Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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UBE3CQ15386 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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UBE3CQ15386 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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UBE3CQ15386 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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UBE3CQ15386 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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UBE3CQ15386 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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UBE3CQ15386 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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UBE3CQ15386 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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