Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHPRHQ149N8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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