Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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