Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAPQ14761 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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