Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
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