Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE7AQ13946 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms