Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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ITGB3BPQ13352 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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ITGB3BPQ13352 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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ITGB3BPQ13352 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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ITGB3BPQ13352 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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ITGB3BPQ13352 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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ITGB3BPQ13352 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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ITGB3BPQ13352 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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ITGB3BPQ13352 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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ITGB3BPQ13352 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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ITGB3BPQ13352 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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ITGB3BPQ13352 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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ITGB3BPQ13352 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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ITGB3BPQ13352 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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ITGB3BPQ13352 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ITGB3BPQ13352 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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