Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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