Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms