Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD47Q08722 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD47Q08722 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms