Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPCQ01831 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPCQ01831 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPCQ01831 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPCQ01831 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms