Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms