Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERVK-16P61578 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms