Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCDC1P59894 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCDC1P59894 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCDC1P59894 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCDC1P59894 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCDC1P59894 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms