Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFIP1P53367 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms