Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP153P49790 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP153P49790 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP153P49790 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP153P49790 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP153P49790 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP153P49790 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP153P49790 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP153P49790 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP153P49790 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP153P49790 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP153P49790 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP153P49790 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP153P49790 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP153P49790 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP153P49790 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP153P49790 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP153P49790 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP153P49790 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP153P49790 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP153P49790 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP153P49790 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP153P49790 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP153P49790 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP153P49790 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP153P49790 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP153P49790 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP153P49790 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms