Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP4P49662 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP4P49662 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP4P49662 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP4P49662 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP4P49662 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms