Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMPHP49418 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMPHP49418 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMPHP49418 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMPHP49418 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPHP49418 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPHP49418 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPHP49418 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMPHP49418 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMPHP49418 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMPHP49418 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMPHP49418 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AMPHP49418 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms