Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NR4A2P43354 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms