Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP2P42575 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP2P42575 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms