Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPARGP37231 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGP37231 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms