Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms