Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms