Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms