Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2H1P32780 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2H1P32780 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms