Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms