Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB2P29033 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB2P29033 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB2P29033 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB2P29033 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms