Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCAP28676 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCAP28676 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms