Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GADD45AP24522 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms