Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms