Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms