Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB6P18564 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms