Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XBP1P17861 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XBP1P17861 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XBP1P17861 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XBP1P17861 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XBP1P17861 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XBP1P17861 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XBP1P17861 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XBP1P17861 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
XBP1P17861 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XBP1P17861 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XBP1P17861 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XBP1P17861 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XBP1P17861 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XBP1P17861 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XBP1P17861 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XBP1P17861 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XBP1P17861 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XBP1P17861 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XBP1P17861 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XBP1P17861 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XBP1P17861 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XBP1P17861 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XBP1P17861 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XBP1P17861 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XBP1P17861 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XBP1P17861 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
XBP1P17861 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XBP1P17861 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XBP1P17861 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XBP1P17861 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XBP1P17861 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XBP1P17861 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XBP1P17861 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XBP1P17861 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XBP1P17861 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XBP1P17861 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XBP1P17861 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XBP1P17861 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XBP1P17861 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XBP1P17861 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XBP1P17861 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XBP1P17861 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XBP1P17861 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms