Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms