Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX7O95931 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX7O95931 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX7O95931 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX7O95931 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX7O95931 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX7O95931 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX7O95931 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX7O95931 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX7O95931 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX7O95931 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms