Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALX3O95076 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALX3O95076 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALX3O95076 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALX3O95076 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALX3O95076 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALX3O95076 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALX3O95076 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALX3O95076 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALX3O95076 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALX3O95076 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALX3O95076 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ALX3O95076 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALX3O95076 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALX3O95076 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms