Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms