Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNQ2O43526 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ2O43526 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms