Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TSPAN4O14817 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TSPAN4O14817 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TSPAN4O14817 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TSPAN4O14817 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TSPAN4O14817 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TSPAN4O14817 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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