Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms