Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms