Protein–RNA interactions for Protein: C9JN71

ZNF878, Zinc finger protein 878, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF878C9JN71 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF878C9JN71 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms