Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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