Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms