Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3Q9UPQ7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms