Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LRFN1Q9P244 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRFN1Q9P244 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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